特別是行政體制對于按照市場(chǎng)機制形成的綜合物流一體化體系具有制約作用。但是，我們也不可忽視我國將港口作為一種準公共資源執行國家戰略職能的傳統特征。這兩方面的職能對社會(huì )經(jīng)濟發(fā)展作用上都各有干秋。但是，如果兩方面職能不能通過(guò)一種統一的協(xié)調機制加以協(xié)調，而通過(guò)一種法制安排加以統一，使我國海運業(yè)的發(fā)展適應世界海運產(chǎn)業(yè)發(fā)展大趨勢的要求，那么，任何一種職能都將無(wú)法實(shí)現。我國當前管理體制制約作用主要表現：

（1)港口產(chǎn)權方面的問(wèn)題我國港口的產(chǎn)權按企業(yè)的關(guān)系和所有制關(guān)系分級管理的模式。港口主管機構既是部門(mén)又是經(jīng)營(yíng)部門(mén)。現行的港口體制滯后于港口市場(chǎng)的發(fā)展要求，制約著(zhù)港航制度化協(xié)調機制的建立。

（2)港口行政管理方面，我國各級行政主管部門(mén)與地方政府對港口的參與和影響過(guò)多，有些方面干擾了港口企業(yè)的運營(yíng)。港口企業(yè)缺乏自主權，完全服從于政府的行政權力，海運經(jīng)營(yíng)業(yè)與港口產(chǎn)業(yè)兩者都無(wú)法滿(mǎn)足自身戰略的發(fā)展需要，更無(wú)法滿(mǎn)足港航制度化協(xié)調機制建立的條件。

（3)港口法律保障方面存在的問(wèn)題采取的是漸進(jìn)的方式，改革的設計只是為了解決某些急迫的問(wèn)題，缺少長(cháng)遠的改革戰略。由于缺少長(cháng)遠的迎接世界海運業(yè)競爭的挑戰的目標，時(shí)下的體制形成的港口與航運經(jīng)營(yíng)業(yè)之間協(xié)調機制的“斷層”似乎很難通過(guò)市場(chǎng)機制來(lái)解決。頒布的法操作性和動(dòng)態(tài)適應性不強。立法的基礎與遠景視野相對薄弱，同時(shí)政策執行的透明度與法制貫徹效果相對滯后。執法部門(mén)間權責不清、責權倒置及交叉的結果是港口產(chǎn)業(yè)監控缺乏權威性和統一性。

同時(shí)，由于賦予了地方政府在戰略中的諸多行政權利，進(jìn)一步造成港口重復建設，甚至形成了目前的大量港口閑置現象。各地在海運業(yè)立足本國積極參與國際競爭問(wèn)題上，忽視了我們海運企業(yè)如何參與國際競爭。完善且明確法制體系是推進(jìn)港航建設的必要前提。法律保障上的缺失，使我國港航供應鏈制度化協(xié)調機制難以建立起來(lái)。